wisegeneusa K003說明書

wisegeneusa的使命是開發(fā)，制造和提供新型基因組測序和檢測技術(shù)的研究工具。我們將繼續(xù)許可，開發(fā)和商業(yè)化表觀遺傳學(xué)中的新基因組測序試劑和方法。

5-羥甲基胞嘧啶是一種DNA甲基化修飾，由鐵依賴性脫氧酶的Tet家族酶促氧化5-甲基胞嘧啶（5-mC）而發(fā)生

關(guān)于我們的TAB-seq套件，請注意以下事項。

TAB-seqβGT保護效率說明

關(guān)于我們的TAB-seq套件，請注意以下事項：

1.我們提供的5hmC加標對照通過使用5-羥甲基胞嘧啶dNTP混合物的PCR擴增產(chǎn)生。原則上，5hmC加標對照中的所有胞嘧啶應(yīng)該是100％羥甲基化的。然而，由于商業(yè)化5hmdCTP的雜質(zhì)和暴露于空氣中5hmC的緩慢氧化，5hmC加標對照中每個胞嘧啶位點的實際5hmC豐度約為80％。結(jié)果，即使在標準亞硫酸氫鹽測序中，5hmC加標對照中僅80％的胞嘧啶將被讀作'C'。該數(shù)量（~80％）可能會根據(jù)5hmC加標控制的存儲條件/時間而變化。

為了準確評估TAB-seq中5hmC的保護率，我們建議對含有相同批次的5hmC加標對照的一個樣品進行標準亞硫酸氫鹽測序，以確定其真正的5hmC豐度。例如，如果5hmC加標對照中80％的胞嘧啶在標準亞硫酸氫鹽測序中讀作'C'，其中70％在TAB-seq中讀作'C'，則表明您的TAB-的實際保護率seq測定應(yīng)為0.7 / 0.8 = 87.5％但不是70％。

2.在βGT保護后，當使用某種聚合酶（例如Taq聚合酶）時，5hmC對照上的濃密5gmC可能停止聚合。為了避免可能的PCR偏差，建議將PfuTurbo Cx hotstart聚合酶（Agilent）或等同物用于文庫構(gòu)建中的終PCR擴增步驟。

5mC Tet1氧化試劑盒

5mC Tet1 Oxidation 

目錄號：K003

單價：每件套669美元

產(chǎn)品說明

5mC Tet1氧化試劑盒可用于將基因組DNA中的5-甲基胞嘧啶（5mC）轉(zhuǎn)化為5-羧基胞嘧啶（5caC）用于隨后的測序應(yīng)用。

每個試劑盒包含足夠的試劑，可根據(jù)推薦的方案進行多達3個全基因組或9個基因座特異性測序反應(yīng)。

存儲

在抵達時在-80℃儲存5mC Tet1氧化試劑盒。Tet1蛋白對溫度敏感; 應(yīng)避免多次凍融。

5hmC TAB-Seq Kit

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Catalog No: K001

Unit Price: $969 / per kit

5hmC/5mC TAB-Array Kit (compatible to Infinium 450K Array)

Catalog No: K002

Unit Price: $869 / per kit

5mC Tet1 Oxidation Kit for the PacBio® RS Instrument

Catalog No: K004

Unit Price: $669 / per kit

5hmC DNA Standard

Catalog No: S002

Unit Price: $30 each

5mC DNA Standard

Catalog No: S001

Unit Price: $30 each

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